如何證明勞動關係，並保護自己的權益？
與老闆B口頭商量的薪酬是，到手1萬多點，如果好的話有股份，1年內辭退有一個月的額外工資補充。
2012年4月15日進公司，沒有籤合同，也無保險。公司6月中旬辦理了公司營業執照。
公司發工資都是直接發現金，無工作牌等證明，也無上班打卡記錄(強烈要求買打卡老闆果斷沒有買)。
11月8號，老闆口頭辭退我。10號為發工資日。
老闆以其他理由扣除我10月份工資，只發11月的幾天工資，並要求我簽署智慧財產權協議。我當時沒有同意。
昨天又到發工資的日子，我跟他簽署了保密協議，協議內容大概就是，我在他公司工作，對智慧財產權保密之類的。
我拿到了幾天的`工資，並寫下了“工資已結，扣除10月份11月份後的三千元整”的字樣。
我放棄原來的工作，離開原來的城市，來這城市，原想跟他一起幹點實在的事情。在這兢兢業業工作。
我帶著下面的弟兄每週6都在加班，一週6個晚上加班到11點多，晚上加班一直從四月持續到十月中旬。
最後還要教他各種網際網路知識，包括寫程式碼。
可他卻把我們初創團隊的6個人全部陸續開除了。還拖欠我們大家的工資(其他人也都沒有發全)，想想，心裡是有些委屈與不甘。
現在，我手上只有一份他簽字的保密協議(他是公司法人)。另外就是8九月份才進公司的兩位同事的工作證明。
問題：
1.這些證據可以確定勞動關係嗎，工作起始時間怎麼算(昨天才最後拿到工資)
2.如何確定工資(我有跟老闆的談話錄音，但勞動部門說不能技術鑑定，不認可)
3.我可以主張些什麼權益
1.保密協議沒有蓋公司的公章，只有法人代表簽字，協議內容有兩頁，是分兩頁打的，而沒有列印到一頁，簽字簽在最後一頁
2.昨天我去勞動局問了，他們說證據不足，不能確定勞動關係，拒絕受理。而且同事也不一定能出庭作證。
我說要走法院，他們說先要勞動局這邊籤份檔案，說拒絕受理之類的檔案，然後拿這檔案才能到法院去告。
現在不知道，就是去法院告的話，結局怎麼樣?
證據還只有那些，但法院應該可以做語音技術鑑定。
與老闆B口頭商量的薪酬是，到手1萬多點，如果好的話有股份，1年內辭退有一個月的額外工資補充。
2012年4月15日進公司，沒有籤合同，也無保險。公司6月中旬辦理了公司營業執照。
公司發工資都是直接發現金，無工作牌等證明，也無上班打卡記錄(強烈要求買打卡老闆果斷沒有買)。
11月8號，老闆口頭辭退我。10號為發工資日。
老闆以其他理由扣除我10月份工資，只發11月的幾天工資，並要求我簽署智慧財產權協議。我當時沒有同意。
昨天又到發工資的日子，我跟他簽署了保密協議，協議內容大概就是，我在他公司工作，對智慧財產權保密之類的。
我拿到了幾天的工資，並寫下了“工資已結，扣除10月份11月份後的三千元整”的字樣。
我放棄原來的工作，離開原來的城市，來這城市，原想跟他一起幹點實在的事情。在這兢兢業業工作。
我帶著下面的弟兄每週6都在加班，一週6個晚上加班到11點多，晚上加班一直從四月持續到十月中旬。
最後還要教他各種網際網路知識，包括寫程式碼。
可他卻把我們初創團隊的6個人全部陸續開除了。還拖欠我們大家的工資(其他人也都沒有發全)，想想，心裡是有些委屈與不甘。
現在，我手上只有一份他簽字的保密協議(他是公司法人)。另外就是8九月份才進公司的兩位同事的工作證明。
問題：
1.這些證據可以確定勞動關係嗎，工作起始時間怎麼算(昨天才最後拿到工資)…